富集气泡图

富集气泡图用位置、颜色和圆面积同时呈现通路的已有富集结果,使显著性与富集规模能够一起比较。

富集气泡图编辑器:数据录入与图表预览

数据录入

标签与配色

PNG / SVG 导出

让数据,清晰可见

通路 · GeneRatio · 基因数 · 校正 P 值

富集气泡图绘图效果

使用步骤

  1. 1

    准备与核对数据

    先查看下面的演示数据与字段说明,确认手中数据符合“通路富集结果”的输入要求。图例数据用于演示,正式制图时替换成自己的记录。

  2. 2

    录入并检查预览

    按当前字段录入,或先从 Excel 等表格整理并另存为 CSV/TXT,再通过“导入数据”检查预览。

  3. 3

    设置图型与图注

    填写有含义的标题、单位和分组名,再调整主题、字号、图例与标签;有来源或方法说明时可添加图注并调整位置。

  4. 4

    导出并保存编辑稿

    选择 PNG 或 SVG,放进实际论文或 PPT 版面核对文字与比例;另存可编辑文件,以便更新数据或重新排版。

详细介绍

富集气泡图是什么,适合表达什么

富集气泡图用位置、颜色和圆面积同时呈现通路的已有富集结果,使显著性与富集规模能够一起比较。各视觉变量对应的指标应由图例明确。

常见名称包括富集点图、通路富集气泡图、GO富集图、KEGG富集气泡图。选图时可以按这些名称搜索,进入后仍需核对本页的数据含义与输入格式。

如何读图与比较结果

先读横轴定义,再分别核对颜色和大小图例。基因比例、富集倍数和计数不是同一指标,原始 P 与校正 P 也不可混读;图形展示不代替富集计算。

数据准备与绘图口径

按本页字段准备通路、GeneRatio、基因数、校正 P 值。至少需要 1 行有效数据。同一指标应使用一致单位,缺失值与真实零值需要区分。

输入已完成的富集分析结果;GeneRatio为0–1小数,基因数为正整数,0<padj≤1。点面积对应Count,颜色对应−log10(padj),不执行富集检验。

适用场景

  • 通路富集报告
  • 基因功能结果比较

数据格式

按下列字段准备数据,至少 1 行有效记录。示例仅用于说明格式。

富集气泡图演示数据(5 行)
通路GeneRatio基因数校正 P 值
细胞周期0.24240.0001
免疫反应0.18180.001
信号转导0.15150.005
代谢通路0.12120.012
细胞黏附0.0880.04
数据要求与统计口径

输入已完成的富集分析结果;GeneRatio为0–1小数,基因数为正整数,0<padj≤1。点面积对应Count,颜色对应−log10(padj),不执行富集检验。

通路
文本 / 类别 · 按格式填写
GeneRatio
数值 · 按格式填写
基因数
数值 · 按格式填写
校正 P 值
数值 · 按格式填写

图例是固定演示数据,正式使用时请替换为自己的数据。

方法与图例参考 ↗

交稿前核对清单

  • 输入字段与“富集气泡图”一致,原始观测和分析结果没有混用。
  • 轴名、单位、分组和样本标识能让读者理解每个数值。
  • 先读横轴定义,再分别核对颜色和大小图例。
  • 图例与颜色对应正确,缩到实际版面后文字仍清楚、标签无遮挡。
  • 图注说明必要的方法与数据来源,区间或误差采用真实口径。
  • 导出图与编辑稿已保存,演示记录已替换为正式数据。

常见问题

富集气泡图需要准备哪些数据?

按字段准备通路、GeneRatio、基因数、校正 P 值,至少需要1行有效数据。每行及每列的含义应与当前图型保持一致。

富集气泡图适合表达什么?

富集气泡图用位置、颜色和圆面积同时呈现通路的已有富集结果,使显著性与富集规模能够一起比较。各视觉变量对应的指标应由图例明确。

富集气泡图采用什么绘图口径?

输入已完成的富集分析结果;GeneRatio为0–1小数,基因数为正整数,0<padj≤1。点面积对应Count,颜色对应−log10(padj),不执行富集检验。

如何调整图表的显示样式?

可在编辑器中调整主题配色、字号、图例和标签。涉及数据本身的比例、单位或统计量时,应先确认输入含义,避免只为视觉效果改变分析口径。

Excel中的数据如何导入?

先按本页字段整理表格,另存为CSV或TXT,再通过编辑器“导入数据”上传。在导入预览中检查表头、数值与分组;数值字段不要混入单位或百分号。

能修改标签、图例和配色吗?

可以通过模块的样式设置调整主题、字号、图例和标签,具体选项随图型变化。正式导出前检查标签是否遮挡、分组颜色能否区分,以及坐标轴是否写明单位。

富集气泡图如何导出到论文或PPT?

使用编辑器的导出入口选择PNG或SVG。PNG适合直接插入论文和演示稿,SVG可保留矢量线条;导出后在实际版面中检查字号、比例与清晰度。

可以保存图表,下次继续编辑吗?

可以保存可编辑文件,之后在学术图表工具中导入,继续调整数据和设置。需要通过使用记录找回时,应确认记录已经成功保存;关闭页面前另存文件更便于迁移。

演示数据可以直接作为研究结果吗?

不能。图例是用于说明数据格式和绘图效果的固定演示样例,正式使用时必须替换为自己的数据,并按实际分析方法和研究设计解释。

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