火山图

火山图把差异倍数与显著性放在两个坐标上,帮助同时识别变化幅度和统计证据。

火山图编辑器:数据录入与图表预览

数据录入

标签与配色

PNG / SVG 导出

让差异,一眼可见

基因 / 样本 · log2FC · -log10(P) · 分组

火山图绘图效果

使用步骤

  1. 1

    准备与核对数据

    先查看下面的演示数据与字段说明,确认手中数据符合“差异分析”的输入要求。图例数据用于演示,正式制图时替换成自己的记录。

  2. 2

    录入并检查预览

    按当前字段录入,或先从 Excel 等表格整理并另存为 CSV/TXT,再通过“导入数据”检查预览。

  3. 3

    设置图型与图注

    在图型设置中核对|log2FC| 阈值、显著性阈值、显著性口径。填写有含义的标题、单位和分组名,再调整主题、字号、图例与标签;有来源或方法说明时可添加图注并调整位置。

  4. 4

    导出并保存编辑稿

    选择 PNG 或 SVG,放进实际论文或 PPT 版面核对文字与比例;另存可编辑文件,以便更新数据或重新排版。

详细介绍

火山图是什么,适合表达什么

火山图把差异倍数与显著性放在两个坐标上,帮助同时识别变化幅度和统计证据。它适合展示已经完成差异表达分析的基因或特征结果。

常见名称包括火山散点图、差异表达火山图、volcano plot。选图时可以按这些名称搜索,进入后仍需核对本页的数据含义与输入格式。

如何读图与比较结果

先读横轴 log₂FC 和纵轴 −log₁₀ 概率,再核对阈值及颜色。原始 P 和校正 P/FDR 的含义不同,不能通过改颜色替代多重检验,也不能从表达量直接假定显著性。

数据准备与绘图口径

按本页字段准备基因 / 样本、log2FC、-log10(P)、分组。至少需要 4 行有效数据。同一指标应使用一致单位,缺失值与真实零值需要区分。

x为外部差异分析的log2FC,y为−log10(显著性概率);图型设置可选原始P或校正P/FDR,并调整FC和概率阈值,默认|log2FC|≥1且P<0.05。颜色、精确参考线与图注采用同一阈值;输入校正P/FDR时须使用相符的纵轴名。不计算差异表达、FDR或显著性检验。

基因/点名 + log2FC + 显著性坐标 + 分组(上调/下调/不显著)

适用场景

  • 转录组差异表达
  • 多特征差异结果展示

数据格式

按下列字段准备数据,至少 4 行有效记录。示例仅用于说明格式。

火山图演示数据(前 6 行)
基因 / 样本log2FC-log10(P)分组
GENE12.46.2上调
GENE21.84.6上调
GENE3-2.15.4下调
GENE4-1.53.2下调
GENE50.30.8不显著
GENE6-0.41.1不显著
数据要求与统计口径

x为外部差异分析的log2FC,y为−log10(显著性概率);图型设置可选原始P或校正P/FDR,并调整FC和概率阈值,默认|log2FC|≥1且P<0.05。颜色、精确参考线与图注采用同一阈值;输入校正P/FDR时须使用相符的纵轴名。不计算差异表达、FDR或显著性检验。

基因/点名 + log2FC + 显著性坐标 + 分组(上调/下调/不显著)

基因 / 样本
文本 / 类别 · 按格式填写
log2FC
数值 · 按格式填写
-log10(P)
数值 · 按格式填写
分组
文本 / 类别 · 按格式填写

图型设置:|log2FC| 阈值、显著性阈值、显著性口径。

图例是固定演示数据,正式使用时请替换为自己的数据。

方法与图例参考 ↗

交稿前核对清单

  • 输入字段与“火山图”一致,原始观测和分析结果没有混用。
  • 轴名、单位、分组和样本标识能让读者理解每个数值。
  • 先读横轴 log₂FC 和纵轴 −log₁₀ 概率,再核对阈值及颜色。
  • 图例与颜色对应正确,缩到实际版面后文字仍清楚、标签无遮挡。
  • 图注说明必要的方法与数据来源,区间或误差采用真实口径。
  • 导出图与编辑稿已保存,演示记录已替换为正式数据。

常见问题

火山图需要准备哪些数据?

按字段准备基因 / 样本、log2FC、-log10(P)、分组,至少需要4行有效数据。基因/点名 + log2FC + 显著性坐标 + 分组(上调/下调/不显著)

火山图适合表达什么?

火山图把差异倍数与显著性放在两个坐标上,帮助同时识别变化幅度和统计证据。它适合展示已经完成差异表达分析的基因或特征结果。

火山图可以使用校正后的P值或FDR吗?

可以在图型设置中选择原始P或校正P/FDR,并使用与输入口径一致的纵轴名。图中显著性坐标需按当前字段要求准备;工具不代替差异表达分析,也不从图形反推或计算FDR。

差异倍数和显著性阈值怎么设置?

在火山图的图型设置中调整FC和概率阈值。默认采用|log₂FC|≥1且P<0.05;分类颜色、参考线和图注使用同一阈值。正式研究应按事先确定的分析口径设置。

|log2FC| 阈值、显著性阈值可以调整吗?

可以在对应编辑器的图型设置中调整|log2FC| 阈值、显著性阈值。选项范围与数据定义一致;如有阈值或单位,应与实际分析方法同时核对。

Excel中的数据如何导入?

先按本页字段整理表格,另存为CSV或TXT,再通过编辑器“导入数据”上传。在导入预览中检查表头、数值与分组;数值字段不要混入单位或百分号。

能修改标签、图例和配色吗?

可以通过模块的样式设置调整主题、字号、图例和标签,具体选项随图型变化。正式导出前检查标签是否遮挡、分组颜色能否区分,以及坐标轴是否写明单位。

火山图如何导出到论文或PPT?

使用编辑器的导出入口选择PNG或SVG。PNG适合直接插入论文和演示稿,SVG可保留矢量线条;导出后在实际版面中检查字号、比例与清晰度。

可以保存图表,下次继续编辑吗?

可以保存可编辑文件,之后在学术图表工具中导入,继续调整数据和设置。需要通过使用记录找回时,应确认记录已经成功保存;关闭页面前另存文件更便于迁移。

演示数据可以直接作为研究结果吗?

不能。图例是用于说明数据格式和绘图效果的固定演示样例,正式使用时必须替换为自己的数据,并按实际分析方法和研究设计解释。

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