
数据录入
标签与配色
PNG / SVG 导出
让差异,一眼可见
基因 / 样本 · log2FC · -log10(P) · 分组
使用步骤
- 1
准备与核对数据
先查看下面的演示数据与字段说明,确认手中数据符合“差异分析”的输入要求。图例数据用于演示,正式制图时替换成自己的记录。
- 2
录入并检查预览
按当前字段录入,或先从 Excel 等表格整理并另存为 CSV/TXT,再通过“导入数据”检查预览。
- 3
设置图型与图注
在图型设置中核对|log2FC| 阈值、显著性阈值、显著性口径。填写有含义的标题、单位和分组名,再调整主题、字号、图例与标签;有来源或方法说明时可添加图注并调整位置。
- 4
导出并保存编辑稿
选择 PNG 或 SVG,放进实际论文或 PPT 版面核对文字与比例;另存可编辑文件,以便更新数据或重新排版。
详细介绍
火山图是什么,适合表达什么
火山图把差异倍数与显著性放在两个坐标上,帮助同时识别变化幅度和统计证据。它适合展示已经完成差异表达分析的基因或特征结果。
常见名称包括火山散点图、差异表达火山图、volcano plot。选图时可以按这些名称搜索,进入后仍需核对本页的数据含义与输入格式。
如何读图与比较结果
先读横轴 log₂FC 和纵轴 −log₁₀ 概率,再核对阈值及颜色。原始 P 和校正 P/FDR 的含义不同,不能通过改颜色替代多重检验,也不能从表达量直接假定显著性。
数据准备与绘图口径
按本页字段准备基因 / 样本、log2FC、-log10(P)、分组。至少需要 4 行有效数据。同一指标应使用一致单位,缺失值与真实零值需要区分。
x为外部差异分析的log2FC,y为−log10(显著性概率);图型设置可选原始P或校正P/FDR,并调整FC和概率阈值,默认|log2FC|≥1且P<0.05。颜色、精确参考线与图注采用同一阈值;输入校正P/FDR时须使用相符的纵轴名。不计算差异表达、FDR或显著性检验。
基因/点名 + log2FC + 显著性坐标 + 分组(上调/下调/不显著)
适用场景
- 转录组差异表达
- 多特征差异结果展示
数据格式
按下列字段准备数据,至少 4 行有效记录。示例仅用于说明格式。
| 基因 / 样本 | log2FC | -log10(P) | 分组 |
|---|---|---|---|
| GENE1 | 2.4 | 6.2 | 上调 |
| GENE2 | 1.8 | 4.6 | 上调 |
| GENE3 | -2.1 | 5.4 | 下调 |
| GENE4 | -1.5 | 3.2 | 下调 |
| GENE5 | 0.3 | 0.8 | 不显著 |
| GENE6 | -0.4 | 1.1 | 不显著 |
数据要求与统计口径
x为外部差异分析的log2FC,y为−log10(显著性概率);图型设置可选原始P或校正P/FDR,并调整FC和概率阈值,默认|log2FC|≥1且P<0.05。颜色、精确参考线与图注采用同一阈值;输入校正P/FDR时须使用相符的纵轴名。不计算差异表达、FDR或显著性检验。
基因/点名 + log2FC + 显著性坐标 + 分组(上调/下调/不显著)
- 基因 / 样本
- 文本 / 类别 · 按格式填写
- log2FC
- 数值 · 按格式填写
- -log10(P)
- 数值 · 按格式填写
- 分组
- 文本 / 类别 · 按格式填写
图型设置:|log2FC| 阈值、显著性阈值、显著性口径。
图例是固定演示数据,正式使用时请替换为自己的数据。
方法与图例参考 ↗交稿前核对清单
- 输入字段与“火山图”一致,原始观测和分析结果没有混用。
- 轴名、单位、分组和样本标识能让读者理解每个数值。
- 先读横轴 log₂FC 和纵轴 −log₁₀ 概率,再核对阈值及颜色。
- 图例与颜色对应正确,缩到实际版面后文字仍清楚、标签无遮挡。
- 图注说明必要的方法与数据来源,区间或误差采用真实口径。
- 导出图与编辑稿已保存,演示记录已替换为正式数据。
常见问题
火山图需要准备哪些数据?
按字段准备基因 / 样本、log2FC、-log10(P)、分组,至少需要4行有效数据。基因/点名 + log2FC + 显著性坐标 + 分组(上调/下调/不显著)
火山图适合表达什么?
火山图把差异倍数与显著性放在两个坐标上,帮助同时识别变化幅度和统计证据。它适合展示已经完成差异表达分析的基因或特征结果。
火山图可以使用校正后的P值或FDR吗?
可以在图型设置中选择原始P或校正P/FDR,并使用与输入口径一致的纵轴名。图中显著性坐标需按当前字段要求准备;工具不代替差异表达分析,也不从图形反推或计算FDR。
差异倍数和显著性阈值怎么设置?
在火山图的图型设置中调整FC和概率阈值。默认采用|log₂FC|≥1且P<0.05;分类颜色、参考线和图注使用同一阈值。正式研究应按事先确定的分析口径设置。
|log2FC| 阈值、显著性阈值可以调整吗?
可以在对应编辑器的图型设置中调整|log2FC| 阈值、显著性阈值。选项范围与数据定义一致;如有阈值或单位,应与实际分析方法同时核对。
Excel中的数据如何导入?
先按本页字段整理表格,另存为CSV或TXT,再通过编辑器“导入数据”上传。在导入预览中检查表头、数值与分组;数值字段不要混入单位或百分号。
能修改标签、图例和配色吗?
可以通过模块的样式设置调整主题、字号、图例和标签,具体选项随图型变化。正式导出前检查标签是否遮挡、分组颜色能否区分,以及坐标轴是否写明单位。
火山图如何导出到论文或PPT?
使用编辑器的导出入口选择PNG或SVG。PNG适合直接插入论文和演示稿,SVG可保留矢量线条;导出后在实际版面中检查字号、比例与清晰度。
可以保存图表,下次继续编辑吗?
可以保存可编辑文件,之后在学术图表工具中导入,继续调整数据和设置。需要通过使用记录找回时,应确认记录已经成功保存;关闭页面前另存文件更便于迁移。
演示数据可以直接作为研究结果吗?
不能。图例是用于说明数据格式和绘图效果的固定演示样例,正式使用时必须替换为自己的数据,并按实际分析方法和研究设计解释。
